协和会八王子分店的电话响起。这是一则讣告，称协会的一名成员被某人袭击并杀害。负责此案的是八隈警察署搜查一课刑警志麻（青柳翔 饰）和年轻人速水（藤原月饰）。他努力调查最近频繁发生的悬而未决的谋杀案。与此同时，为了给朋友的死报仇，协和会在年轻首领冰室（本宫泰夫饰）和首领田村（山口义行饰）的带领下，开始抢在警察之前搜寻真凶。事件发生后，警方与协会发生冲突。而这起事件的谜团也因此加深。有一个大型组织正在摧毁志摩、速水和协和会。
Rosana是家中的顶梁柱，她努力工作挣钱照顾生病的母亲。尽管了最大的努力，可她还是被解雇了。在绝望中，她愿意做任何事情，哪怕是为了得到遗产假扮富翁的女儿。在这个陌生的家庭中，Rosana不得不与有权有势的Korn打交道，而他一心想证明自己的真实身份。
镇国将军嫡女徐楚韵因青梅竹马的副将孟琦为救自己而死，从此封心锁爱时至徐家发生危机，徐楚韵为了保全徐家自愿入京等待皇帝赐婚。执棋之人，身亦在局中，赤子之心，何以藏算谋?在东宫各自谋划着自己的未来。
这是一个围绕着小提琴、有关父与子的故事… 这一次的敌人是以生命能量为食而生存的吸血鬼族中的Fungaia。与之战斗的人，便是在继承自父亲的工坊中制作小提琴的红渡。尽管依靠腰带的力量，他变身为假面骑士牙，但是对于自己为何能变身，为何不得不战斗，现在还尚未可知。然而，实际上，与Fungaia战斗的并非只有渡一个人。22年前，渡的父亲——音也已经从那时开始与猖獗的Fungaia战斗。 故事一边将渡所在的现在、以及22年前——年轻的音也结婚并生下名为渡的孩子之前——紧密地联系起来，一边发展。 22年前，音也未能铲除的Fungaia不断繁衍，并出现在现代的日本。渡化身为假面骑士牙，将其打倒，并以此形态将过去与现在相连。 然而，存在的并不仅仅只是双眼所能看到的形态。在各个时代生存着的人们的命运，将会与怎样的形态相连呢？为什么Fungaia的出现，会威胁到人类的存在呢？身在其中的渡和音也所背负的命运又是…？ 各种各样的人物，生活在各种各样的时代，故事正在发展。知道这2个时代的人，只有2个…那就是将Fungaia Hunter组织化的岛，以及22年前开始经营咖啡店「Coffee Mall Damour」的木户师傅。沉浮于2个时代的人们，掌握着他们命运关键的，是这2个人，还有父亲所留下的小提琴…！？
