本季延续《西行纪》前一季剧情，讲述了唐三藏与师徒四人取得奇经交予天宫的十六年后，为了心中正义，再次集结成“西行小队”，重新踏上“还经”之路的故事。
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故事发生在市立里滨高中内，有原翼（西田望见 配音）是刚刚升上高中的校园新鲜人，曾经，身为棒球队队长的她对甲子园怀揣着无尽的希冀，但一场意外让她在心灰意冷之中放弃了梦想。如今的高中是一个没有棒球部的学校，虽然暗地里松了一口气，但有原翼同时还感到了小小的失望，难道棒球真的是她无法割舍的梦想吗？出生于棒球世家的傲娇大小姐东云龙（近藤玲奈 配音）、拥有魔鬼身材，个性温柔非常会照顾人的野崎夕姬（南早纪 配音）、个性活泼开朗的天然呆河北智惠（井上穗乃花 配音），在学校里，有原翼结识了这些对棒球充满了热情和兴趣的女孩子们。
心怀对同伴的思念，向自己所相信的道路前进！经历了与黑暗公会“冥府之门”的激斗，以及与养育之亲“火龙伊格尼尔”的悲哀离别，纳兹为了变得更强而与伙伴哈比一同踏上修行之旅。另一方面，“妖精的尾巴”会长马卡洛夫突然下达了公会解散命令，自己也隐藏了行踪。此后约1年，露西一边做着见习记者的工作，一边收集着散落大陆各处的旧时同伴的情报。之后，在一年一度的“大魔斗演武”进行取材的某天，结束了修行的纳兹出现在露西面前！宣告魔导士公会“妖精的尾巴”的复活，怀着同样的信念，纳兹、露西、哈比的寻找同伴之旅开始了！！
