故事以猫咪的视角瞥见激烈的战场、历史的一瞬、动人的亲情、未来的幻想；通过水墨、二维、三维、定格等多样化形式呈现极具东方韵味的中式美学；十个光怪陆离的有关于猫咪的神秘画卷徐徐展开。
环境恶化、资源枯竭、道德沦丧，人类文明在一场毁灭性的灾难后，湮灭殆尽，整个星球满目疮痍。历经万年，许多部落和新物种诞生并繁衍，西域孕育出一个全新的文明 。新人类将上一纪元称为“上古”，曾毁灭上古文明的巨大能量被封存在一个叫“众神遗迹”的禁地。
暑假临近，大家为露营地点的事而争执。大雄（小原乃梨子 配音）和静香（野村道子 配音）想去海滩，胖虎（立壁和也 配音）和小夫（肝付兼太 配音）则想去爬山。最后，在哆啦A梦（大山羡代 配音）的提议下决定去海底山探险。而到了海底，胖虎和小夫却想总想着去幽灵船寻宝，结果遇到了危险，大家也意外发现海底居然也居住着人类。进而发现亚特兰提斯和姆联邦这两个国家争相进行军备竞赛，得知亚特兰提斯预备发射鬼角弹的事，如果亚特兰提斯发射鬼角弹，那么全世界都会毁灭，因此为了阻止鬼角弹发射，大雄他们决定去亚特兰提斯的百慕大海域阻止这个阴谋。勇敢的少年们能拯救地球吗？
十年“欢喜冤家”猪鸟依旧如往常一样“互相拆台”。然而，“不速之客”发射冰球袭击了小鸟岛和猪猪岛，令双方不得不放下芥蒂，小鸟岛昔日英雄胖红联合小鸟伙伴们与曾经的对手“捣蛋猪”雷纳德一行组建了临时联盟，他们将前往全新冰封岛屿上阻止神秘反派的灭世计划。
女仆萍儿跟着老婆婆在高塔里照顾世界上仅存的两条龙。一条龙死去后，萍儿发现了一颗龙蛋，但它却被人称为智慧之珠，被夺走献给皇帝治病。为了找回龙蛋，萍儿救出了最后一条龙丹子，并和它一起踏上了冒险之旅。
位于东京的东都线地铁开通当日，一起针对东京都知事朝仓优一郎的炸弹袭击事件爆发，导致东都线列车损毁。经过一番推理，柯南（高山みなみ 配音）等人认定这与8年前朝仓主持负责的北之泽水坝的修建有关。当年为了修建大坝，朝仓动员北之泽村的人民搬入新村，可是仍有许多人反抗到最后阶段。为了探明真相，柯南、灰原（林原めぐみ 配音）、少年侦探团以及毛利小五郎（小山力也 配音）等人开赴白雪皑皑的北之泽。在这片纯净的雪国，少年们尽情玩耍，与此同时他们也遇到了几名原北之泽村的村民，山尾溪介、远野瑞希、立原冬美等人。他们是从小一起长大的好朋友，而彼此之间似乎又有着某种芥蒂和秘密。真相究竟如何…… 本片为《名侦探柯南》第15部剧场版。
