该动画讲述了执行官狡噛慎也在与监视官常守朱、同事征陆智己、縢秀星、六合冢弥生的合作下，制服了一个又一个险恶的犯罪分子，但狡噛慎也在执行任务的同时，对全靠数据说话的系统产生了怀疑的故事。
普通高中生四月一日君寻（福山润 配音），有着异于常人的体质，他可以看到并且吸引各种鬼怪，而如果和同学百目鬼静（中井和哉 配音）在一起时，就不会被鬼怪缠上。因为命运的牵引，四月一日走进了一家奇怪的店里，这是一家可以帮客人实现任何愿望的店，但是店主人壹原侑子（大原沙耶香 配音）同时要拿走和这愿望对等的代价。侑子答应帮四月一日实现远离鬼怪的愿望，而作为代价，四月一日要留在店里打工。 有一天，一个阴郁的少女走进店里，委托侑子实现自己的愿望。由此，侑子、四月一日和百目鬼三人来到了一所诡异的豪宅里。在这里，他们遇到一群奇奇怪怪的收藏家，同时，四月一日在这所大房子中遭遇了各种各样的灵异事件，犹如在仲夏夜里做了一场诡秘的梦…
一个崇拜奥特曼的男孩小勉,在一次奇妙的际遇中得到了一个红色的玻璃球,原来那是一个能够实现愿望的神奇球,而它可从不同人许下的愿望中更加彰显出许愿者心灵的善恶.....
西宫硝子（早见沙织 饰）生来患有听觉障碍，要依靠助听器和外界交流，口语发音也因此格外的古怪。小学时，硝子转入了一所新的学校，特殊的生理缺陷让她成为了班上引人注目的独特存在，她因此收获了坚实的友情，却也遭到了以男生石田将也（入野自由 配音）为首的小团体的孤立和排挤。随着时 间的推移，无心或有意的恶作剧渐渐升级，最终演变成为了无法挽回的伤害，硝子永远的消失在了众人的眼前。
菲利普与佐伊是一对星际宇航企鹅，以航向无雀能至的外太空为志。他们乘着那艘平易近人、会说话的太空船“雪泥号”，在敬爱的斯黛拉船长带领下，身怀实地考察大本营的任务，向着星辰踏上了一番和平的探险。
混沌数学家伊恩·马尔科姆（Ian Malcolm）博士在找到他的日记后，回忆起30年前岛上游乐园的不幸和混乱，那里充满了史前恐龙，它们逃跑并疯狂奔跑......一个故事：6500万块砖块在制作中。
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故事發生在被選召的孩子們首次接觸數碼世界的6年後。2005年的一天，東京港區海面上的波浪在朝陽下搖曳……17歲的高中生八神太一，如常地用手按停眼前的鬧鐘，踢開混亂的被鋪，低聲滴咕下伸展四肢。拉開了窗簾，光線照到桌上一幅「那一天」的集體照上。隨後他在「一路順風，哥哥」的送別聲下，騎上腳踏車出門，奔向那片初夏的青空……現在，冒險再度進化……
