《321哆布哆》中的哆布哆是来自宇宙多多星球的外星宠物，一次飞船坠毁使它迫降地球，这次意外使他结识了生活在地球上的孩子们。哆布哆和地球上的孩子们组成囧囧特搜队， 他们要完成一个接一个的冒险任务。在冒险中过程中，哆布哆和孩子们结下了深厚的友谊，成为彼此最忠诚的伙伴。
这个故事发生在上世纪七十年代，主要围绕着曾向阳（唐曾 饰）、小池（战菁一 饰）、于百家和陆小燕等人展开。曾向阳和小池是一对纯洁相爱的恋人。然而，曾向阳误会父亲出轨，导致母亲意外死亡，妹妹走失，父亲伤残。为了寻找妹妹，曾向阳不得不与小池分隔两地。于百家暗恋小池，借助漂亮女孩张闹设计陷害曾向阳。曾向阳被冤入狱，小池在百般误会中嫁给了百家。与此同时，同事陆小燕善良真诚，坚信曾向阳无罪并向他表达了爱意。在艰难岁月中，曾向阳和小燕的感情逐渐加深。贾管教是曾向阳的良师益友，文革结束后成为法院院长，帮助曾向阳洗脱冤屈重返社会。最后，曾向阳准备与小燕结婚，开始新生活。然而，于百家和张闹为了谋得曾家的房产，再次设计圈套。在小燕的帮助下，曾向阳识破了诡计，保住了家族的文化遗产，即曾家大院。
一家人到重庆旅游回来后，赵亚平为了赵奕欢的学习和生活举家从南京搬到了盐城，但是一大家子搬到盐城以后却出现了各种不适应。王晓娟的前夫贾有财不请自来，还把继子游小毛留在了家里。游小毛虽然调皮捣蛋，但他小发明也让人另眼相看，逐渐得到大家的认可。这时贾有财的债主找上门，游小毛带领小朋友们沉着应对，打败了债主，自己也终于和父母团圆了。
这次故事的舞台发生在海关入境处。作为入境处总入境助理的方浚杰（郭晋安 饰）一直以来都安于现状，因为曾经和上司麦启铭（姜大伟 饰）发生过冲突，对升值也不再抱有希望。和在深圳相识的内地女子张思敏（姚嘉妮 饰）结婚，终于等来了申请成功，本以为就此可以一家团聚的浚杰，却因为大嫂对妻子的排挤，矛盾颇多。为家务事烦恼的浚杰接到了更大噩耗是，妻子居然多年前曾在香港犯案，这让正义感颇强的浚杰无法接受。在妻子离开的过程中，浚杰的同期好友叶安琪（蒙嘉慧 饰）对他照顾有加，在这当中，浚杰同安琪的感情在滋长。而后，浚杰又认识了港口管制组入境主任欧顺风（邓健泓 饰），从误会到冰释前嫌，二人迅速结为好友。而浚杰也也迎来了其事业的转机…
