《打黑重案组》故事发生在南方市，当地的公安局打黑重案组遭遇到一桩棘手案件。在破案过程中，重案组受到各种各样的阻挠，案件侦破几度中断。但公安局长和乾警们不为困难所阻，不顾自己和家人所遭受的苦痛，坚持调查最终查清案情，一举打掉了南方市的黑恶组织。2006年初秋，滨州市、香港乔氏地产公司驻滨州市项目代表郑天京被人在住所谋杀，他的尸体当晚被埋进了工地垃圾堆中……市公安局长陆啸天(卢奇饰)命刑警支队重案组长刘英来(祝延平饰)率重案组成员姚晃(吴樾饰)、依蔓(李依蔓饰)和飞飞(马丁诺饰)赶到案发现场投入侦查工作。重案组严格对死者死亡时间保密，发现死者与龙心集团董事长张伟及其部属有密切联系。张伟出身黑社会团伙，掌控滨州市黑白两道……同时，被刘英杰逮捕的杀手大脚(李槐龙饰)从服刑地新疆脱逃，潜回滨州市，被老大张伟窝藏起来。大脚仇视刘英杰，打算干掉刘英杰……重案组民警李晓(于龄童饰)和派出所民警联手捉拿大脚，大脚老奸巨滑溜掉。张伟得知大脚出外生事，将他训斥一顿，命他在密室上网，不准外出……
传说，嘉南平原有一位神秘侠医...只要有需要的地方，他一定都会到，只要病人想活，他就会让他活下去。医生杜乐生（王识贤 饰）因20年前一场巨大灾难，离开令他失望的医院体制，从此隐身在小诊所中，化身医疗外送员，抢救紧急患者，也修补自己内心的创伤与愧疚。杜乐生与地方综合医院副院长李志豪（柯叔元 饰）间亦敌亦友的强强对决，加上处事强悍但内心柔软的女医生徐敏安（陈嘉桦 饰）总在关键时刻介入。然而接连不同的医疗事件发生，让杜乐生了解到他必须改革体制，也将引爆20年前大灾难真相所隐藏秘密。
在大火摧毁了位于门房的民宿（和主要收入）后，Alison和Mike开始探索其他维持生计的办法，仔细盘算着生活新篇章，而这可能对鬼魂们的（往生）生活造成巨大影响。
在阴沉的蓝港市，女刑警安颖如都市脉搏的守望者，直面着城市的阴暗面。一桩离奇的交通事故，五具尸体内藏匿着大量毒品，将才华横溢的医学博士冷文宇推向了风口浪尖。然而，调查途中，一场突如其来的医学院大火，无情地吞噬了冷文宇的生命，线索戛然而止。冷文宇的妹妹冷文琦，无法接受哥哥自杀的定论，立誓成为一名法医，为逝者发声。五年后，安颖历经生活的洗礼，成为了坚强的单亲妈妈和优秀的警队队长。冷文琦也从医学院毕业，二人如命运安排一般在案件现场再次重逢，共同联手揭开多起非自然死亡案件背后的真相。在记者萧晨的协助下，冷文宇死亡的迷雾逐渐散去，层层疑云被拨开，幕后真凶显露。冷文琦将哥哥的研究成果献给国家，延续他救助病患的遗愿。安颖、冷文琦和萧晨，用勇气和智慧，驱散黑暗，守护着这座城市的安宁与美好。
