基因石能量渐渐恢复成基因石，且显露出更强大的力量、更多不为人知的秘密。反派势必不会轻易罢休，将以更强大的姿态卷土重来。但在艰难的挑战中，普力士等人仍看到了希望：宇宙中，分散著为数不明的「变形联盟战士」，这群代表正义的首领勇士若聚集起来，将会成为一股巨流，一起勇敢地为守护地球而战！
佐伯丽奈（原奈津子 配音）是一名平凡的高中二年级女生，个性十分开朗活泼的她对世间的一切都充满了浓重的好奇心。朝比奈凉香（藤田奈央 配音）是丽奈的同班同学，一头利落短发的她，性格像男孩一样大大咧咧，不仅运动神经非常发达，成绩也常年霸占年级第一名的宝座。五十岚琉璃子（徳井青空 配音）是丽奈青梅竹马的玩伴，沉默寡言时常放空自己的她实际上拥有超强的灵感力，常常能看见别人看不见的东西。
讲述了三个可爱又有各种小缺点的孩子为救父母，在故事奶奶的教导下，克服困难，打败了波波头的邪恶力量，净化了受污染的桃源仙境。最后，不仅救回了父母，自己也逐渐成长为有道德、负责任的美德少年。
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