静电超强力？午饭变酸了！没想到这个世界除了有烦恼星人，还有麻烦分子！麻烦分子比烦恼星人还小，小到肉眼看不见，超迷你战士必须把自己缩小到千分之一，才能进入纳米世界打击新形态的敌人；麻烦分子看起来天真无辜，却能对人类世界造成极大的麻烦，到底它们从何而来，又有什么目的呢？快呼叫超迷你战士，打败你的麻烦！
一支由四名外星人组成的小队逃离了爆炸的家园，却坠毁在美国郊区一栋随时可以入住的房子里。他们对地球是可怕还是美好的看法不一。科尔沃（贾斯汀·罗兰饰）和尤米拉克（肖恩·吉布朗尼饰）只看到污染、粗俗的消费主义和人类的弱点，而特里（托马斯·米德蒂奇饰）和杰西（玛丽·麦克饰）则喜欢人类以及他们所有的电视、垃圾食品和有趣的东西。他们的使命是保护 Pupa，这是一台活着的超级计算机，有一天它会进化成真正的形态，吞噬他们并改造地球。
主角樊凌霄是凌霄阁少年掌门，将一条小鲇鱼进化成了吞天噬地的灵鲲，名震天下。但在一次对决中灵鲲进化失败，竟然弑主。因为夺舍涅槃的能力，一年后樊凌霄占据他人身体再次苏醒，凌霄阁因为掌门的死亡渐渐破败了，这一次他和他的灵鲲再次带领凌霄阁走向巅峰！
白云川市。一个除了学园都市之外，毫无特色的城镇。人们努力振兴城镇，吸引游客，但一切努力都失败了。然而，他们最终却以意想不到的方式吸引了公众的注意。一个行事粗鲁却又责任心强、干劲十足的可靠青年。新海翔。他原本过着普通学生的平静生活，但当白蛇津云神社的神器遭到破坏时，翔的日常生活发生了改变。在阴影中，存在着觉醒了超能力的少年少女。他本应只是生活在毫无特色的城镇里的另一个普通学生。他卷入了由拥有超能力的人展开的奇异命运……
