《幕后真凶》是一部以缉毒警察为题材的案件悬疑剧，剧情跨越了20多年，讲述了两代缉毒警察的故事。三十多年前，在松江土地上发生了一起生物制剂非法出境案，随着此案的发生，缉毒刑警计春生失踪，卧底警察楚江河生死不明，而作为案件核心的CH型生物试剂不翼而飞，此案成了一桩悬案。而就在二十多年后的现在，当年的缉毒支队成员高平率领着楚江河的儿子楚白以及一众干警势要查清当年的真相，化工广场大爆炸、四名被绑架的孩子、同一时间互相杀人的死者、摩天轮焚尸等一系列奇案的发生让真相逐渐浮出水面，但随着接近真相，一直藏在暗中的那双手使这桩跨越二十余年的大案更加扑朔迷离起来，随着刑警米乐儿的失踪，众人这才意识到，藏在黑暗背后的那双手，竟然是“他”！最终，这个尘封20年的大案终于侦破，而背后的真正元凶却是谁也未曾猜想到的。可无论如何，楚白完成了自己的梦想，为当年卧底的父亲正名，让父亲住进了烈士陵园，而自己，最终继承了父亲的警号。
大唐中宗景龙年间，两大名捕裴逸飞（吴镇宇）、淳于子鸿（戴志伟）及神医宋轩（甘国卫）本乃好友，三人同时爱上酒馆女主人麦菊儿（梁佩玲），而菊儿独钟情于逸飞，宋轩知难而退，与寡妇慕兰（张凤妮）展开另一段恋情。但子鸿却不忿，加上事业有所不及，为击败逸飞，而误入魔道。女线人上官晶晶（林其欣）暗恋逸飞，惜襄王无梦，晶晶失意之余，机缘巧合之下与微服出游的李隆基（杨得时）结识。韦后（李丽丽）夺权，毒杀皇帝，把持朝政，子鸿助纣为虐，隆基则得晶晶、逸飞及胡姬（郑艳丽）相助，与韦后对抗，连场明争暗斗，隆基终败韦后，力保大唐江山。子鸿失去靠山，转而加入金魔王（叶天行）之幽灵帮，继续对付逸飞，并杀死宋轩，逸飞悲痛欲绝，加上其妹裴凌（姚正菁）亦间接死于子鸿之手，逸飞誓杀子鸿报仇。此时，逸飞却查出菊儿竟是幽灵帮一份子，其真正身份是……
讲述一起长大的四个女孩，成年散落天南海北，但各自人生的一次转折让她们再度重聚成都。面对阔别多年的故乡，她们经历着从不适应到再熟悉的过程，在挫折中找到了事业的新方向，收获了友谊、亲人的抚慰和爱情的美好，最终她们发现，在故乡也能找到人生的无限可能的故事。
