崔家药铺大小姐崔紫苏与县中富甲一方的段家银号之子段文彬青梅竹马，情投意合。
忍者神龟回来了！这次是以电视剧的形式。当神龟们被人类接纳，一边上高中一边继续他们的超级英雄生涯时，他们面临着同时兼顾两件事的巨大压力。除了1987年电视剧中的经典反派施莱德之外，神龟们还要与他展开战斗。
百团大战前夕，华北大地上抗日烽火遍地燃烧。云城日军最高指挥官秀夫是一个战争狂人，他立誓要摧毁一切抵抗者的意志。在一次清剿战中，他注意到杀死野田少佐后冲出包围圈的甘愿，发誓要抓住此人。甘愿死里逃生，遇到了正在执行任务的八路军小分队队长哥哥甘新。不料途中再次遭遇秀夫伏击，哥哥甘新的小分队战士全部牺牲。为了完成哥哥的遗愿，甘愿代替哥哥前往云城与地下党接头，并利用逃亡的劳工组建了一支抗日小分队，在地下党员彩云的领导下，炸铜矿、炸铁路、拔炮楼、阻劫军火车队，完成了上级交给的多个任务，成为秀夫的眼中钉。经过多次战火考验，小分队的每个成员逐渐成长为合格的八路军战士，最终完成了营救监狱抗日志士这个看似不可能的任务。独立团首长给予小分队嘉奖，夸他们是在战火中成长起来的战士。
蒋介石四一二政变清党行动中，赵惊蛰的父母被害、妹妹失踪，仇人是他最爱的女生欧阳小满的父亲欧阳尊。惊蛰忍辱负重，死里逃生后成为青峰岭的土匪老大。惊蛰将土匪改造成一支半正规军，与仇敌欧阳尊率领的十八团对抗。抗战爆发，日军入侵青峰岭，十八团因为情报泄露惨败，而惊蛰被诬成汉奸。我党地下组织接触惊蛰，说服他团结抗日。惊蛰将计就计潜入日军情报系统，找出了令十八团惨败的日军情报特务“蜻蜓”，但“蜻蜓”却是他亲妹妹赵小雪。在亲情与民族大义的抉择中，惊蛰毅然做出决定，设计令“蜻蜓”上钩，将假情报泄露给日军。最后，日军因为假情报做出了错误的战略布局，被十一军和十八团联手重创，撤出青峰岭。惊蛰最后与敌同归于尽，死后被追认为中共党员、抗日烈士。
