《男子高中生的日常》以真田北男校为舞台，围绕着主角忠邦（入野自由 配音），以及他的死党秀则（杉田智和 配音）和吉竹（铃村健一 配音）的日常高中生活而展开。忠邦主要担任吐槽的角色，长相中性的他常常被秀则和吉竹联合欺负。登场人物还有同校学生会的元治、唐泽、副会长和会长等人，这是一群基本上没有女朋友的男校学生，在鲜有女生参与的情况下，展开了插科打诨的日常高中生活。
梦原希美有时可能会笨手笨脚，但她总是开朗而积极。她是一名普通的初中生，却遇到了来自帕米尔王国的神秘妖精可可，为了守护大家的希望，她与朋友们联手，化身为希望之光、治愈之梦，共同面对对抗强大的敌人。时光流逝，希美和她的朋友们已经长大成人。他们各自走向未来。尽管她的工作、私人生活、朋友、家庭和爱情过着有趣而忙碌的生活，但她仍然在与成年以来所面临的问题和障碍作斗争。与此同时，攻击人类的神秘阴影突然出现……！当钟楼的钟声响起时，希美和她的朋友们长大成人的新故事开始了！
初中时经历过100次心碎的爱城小太郎，终于在高中找到了女朋友！当她在神社祈祷时，爱之神出现并告诉她，她注定会在高中遇到 100 个人。然而，根据上帝的说法，如果一个人遇到了自己的灵魂伴侣，却没有爱上那个人并找到幸福，他们就会死去……与灵魂伴侣的一次次邂逅正在等待着他——小太郎将会怎么做呢？这100个女朋友的命运将会如何？ ？
动画以被神秘的外星人德拉克特毁灭了几乎所有人类的地球为舞台展开。过去人类为了躲避外星人而藏身的避难所伊克西亚，毁灭之日的记忆被抹去的居民们什么都不知道地过着普通的生活。但是住民中也有一部分的“被选中的人”们，驾驶着名为罗格的巨大机器人与外星人战斗着……
