一支由四名外星人组成的小队逃离了爆炸的家园，却坠毁在美国郊区一栋随时可以入住的房子里。他们对地球是可怕还是美好的看法不一。科尔沃（贾斯汀·罗兰饰）和尤米拉克（肖恩·吉布朗尼饰）只看到污染、粗俗的消费主义和人类的弱点，而特里（托马斯·米德蒂奇饰）和杰西（玛丽·麦克饰）则喜欢人类以及他们所有的电视、垃圾食品和有趣的东西。他们的使命是保护 Pupa，这是一台活着的超级计算机，有一天它会进化成真正的形态，吞噬他们并改造地球。
冷酷无情的邪恶组织参谋，某天遇见了与之对抗的魔法少女，然后对魔法少女一见锺情了。从此邪恶参谋在策划统治世界时也不忘买甜点蛋糕送魔法少女吃、在计划奴役人类时也不忘关心魔法少女、在壮大邪恶组织势力的同时也不忘和魔法少女打情骂俏。同事来帮忙就扯同事的后腿、部下抓住魔法少女就放 走魔法少女，一场最残忍最傲娇最悲戚最可爱的正与邪的搞笑战斗，在此揭开序幕！
“信号塔大战”后，熊大、熊二和光头强的缩小器再度遗失。三人组合继续留守不夜城，找寻缩小器的回家之路更是状况频出，但他们从未放弃希望，最终与小动物们合力拯救小镇，呈现了一场精彩惊险的微观世界冒险之旅。
