许多年过去，地球在Z战士的保卫下日渐和平与繁荣。某天，皮拉夫大王和他的爪牙历经千辛万苦来到神殿，找到了神仙与比克大魔王分身前制造的黑星龙珠。由于孙悟空的突然出现，皮拉夫慌忙之中许下让孙悟空变成少年模样的愿望。在此之后，黑星龙珠散落到宇宙各个角落，如果在一年之内无法找到七颗黑星龙珠的话，地球将会爆炸毁灭。情况危急，小悟空和孙女小芳开始了一段惊险刺激的宇宙大冒险。超级17号、邪恶龙等强大的对手接连出现，悟空面临更大的挑战……
故事发生在一个名叫纳特拉的王国之中，王子维恩（齐藤壮马 配音）在父亲病倒之后，终于独自一人肩负起了治理整个国家的重任。纳特拉实在是太过于弱小了，每天都在遭受周边强国的霸凌和侵略，维恩既没有足够的钱来整顿内政，有没有足够的战力去侵略掠夺别国资源，慢慢的，国内的人才纷纷流落到了其他国家之中。而维恩最大的愿望，就是能够早日卖掉自己的国家，过上闲散的生活。
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本剧讲述超级飞侠继续从全新的超级空间站出发，升级为电能超级飞侠，前往世界各地旅行，在旅行过程中邂逅世界各地的小朋友，并用升级电力技能帮助小朋友们解决种种困难和问题的故事。如在哈尔滨冰雪节，他们用高超的电能技能阻止了金小子、金小薇造成的冰雕骚乱；在澳大利亚的伍伦贡，他们通过时空旅行穿梭到恐龙时代，和翼手龙宝宝一起练习飞行；尽管困难不断，但电能超级飞侠会用炫酷的新技能、新装备，继续圆满地解决问题。
