《NORN9》讲述在穿越时空所到达的世界，少年与3名少女及9位年轻人相遇。少年与他们一同踏上了空中旅程。他们开始旅程的理由是什么？目的地又是哪里？还有，这个【世界】究竟是什么？怀揣各种各样的疑问，船正在前进。朝向故事的终结。编织羁绊的未来，现在正要开始。
时为公元2202年。自从宇宙战舰大和号从那场单程长达16万8000光年、通往伊斯坎达尔的壮大航海中回归以来，已经过了3年——。在“宇宙恢复系统”之下取回先前蓝色样貌的地球，与卡米拉斯帝国缔结了和平条约。在复兴的同时，为了防卫而进行的包含最新锐战舰安德洛墨达在内的新锐舰队的整备工作也在推进中。伊斯坎达尔的丝塔夏的愿望也化为乌有，地球开始迈向扩军之道。这真的是在无可替代的多数牺牲之后，大和所达成的真正的和平吗？期盼宇宙平稳的女神特蕾莎的祈愿，将大和邀往新的航海。如今，席卷宇宙的加特兰蒂斯的威胁，正在逼近地球——。
在一个自然保护区的废弃护林员小屋中，住着一只大灰熊，和人一样享受着各种现代设施。然后来了一个大家族——一大群旅鼠们，也搬进了小屋，从此和大灰熊产生了各种爆笑故事。
一对一起做实验的高中校友守着一个秘密：其中之一的Marshall发现了全世界最厉害的药物，是一种可以治愈几乎一切病痛的蘑菇。但是，要将它介绍给全世界是非常艰难的：美国缉毒局、大型制药公司和国际上的商人们都想阻止其面市。
