《百妖谱》第四季动画故事讲述，桃天带着小和尚磨牙、小狐妖滚滚和
皇帝巡海之际，太子建文亲眼目睹了自己亦师亦友的郑提督突然弑君，反被朝廷诬陷为弑父夺位，慌乱中驾驶了青龙灵船逃回泉州欲返回金陵向燕王叔叔，郑提督接受监国燕王的命令回到泉州对建文进行缉拿，建文太子识破之后从泉州开启了往南的逃亡之旅，建文逃亡途中结交了东瀛忍者七里、蒙古水师统领腾格斯，博物学家佛郎机人哈罗德，四人在冒险途中结下了真挚的友情，准备展以南海蓬莱岛最大海盗破军基地为目标的逃亡查明郑提督弑君的真相之旅；此时朝堂内外各方势力蠢蠢欲动，郑提督又该如何在这样的条件下继续保护对自己误解愈深的建文和查探皇帝魔化事件的真相呢？
五灵根废柴林墨遭青梅柳若烟与天才师兄沈清舟联手构陷，灵根寸碎，被钉锁妖崖，含恨坠向万丈死渊。濒死之际，他的鲜血意外解封崖底沉睡千年的魔宗圣女苏凌曦，得传上古奇功《九转凡仙诀》——无需灵根，以凡躯历九次生死涅槃，锻骨炼魂，绝地逆袭。他重归宗门，于万众瞩目下废掉仇敌，夺回林家传承。秘境探踪，揭开千年前正魔大战的尘封冤案，师徒二人也从相依相守渐生情愫。携挚爱共渡天劫，一介凡骨，终等仙阙！
金无足天生异体能自由进出仙凡两界，在爷爷紫玄真人的指引下开设了一家专门面向神仙兜售凡间物品的代购店。金无足将现今多类新潮产品络绎不绝运入天庭，对仙家的传统生活造成了巨大冲击。金无足八面玲珑善于经营，陆续与二郎神、猪八戒、孙悟空等神话人物日益交好，开店闲暇之余还承接委托上天入地寻宝捉妖业务广泛，更是桃花运不断深受仙人妖魔各色女子青睐。某日金无足私带嫦娥仙子下凡游玩，没想到此举竟招来一段连环祸事……
从教会都市出发的商人罗伦斯与贤狼赫罗，为了收集赫罗的故乡约伊兹的情报，而来到了冬季有着大祭典的热闹城市库梅尔森。在这里两人与鱼商人阿玛蒂邂逅了，而且阿玛蒂对赫罗一见钟情，并迅速开始对她展开追求攻势。另一方面，罗伦斯却和赫罗之间的微妙感情却因此加深了误解。然后，罗伦斯和阿玛蒂又因为各自的生意被卷入了大骚动中。
