1989年，日本。乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发前往DIO的所在地——埃及。
小时候看过夏依妮·莎莉温的魔法表演后，梦想成为魔女的阿科，进入了与莎莉温相同的传统魔女育成名门校“露娜诺娃魔法学校”。
佐久千岁就读于县内顶尖的预科学校——藤志高中。凭借着优异的学业、体育和沟通能力，佐久无论好坏都备受瞩目，身边还有一群人人羡慕的魅力四射的朋友。二年级的春天，佐久转入了一个新班级。他被委托帮助一位隐居的学生改过自新。这是一个感人的成长故事，故事背景设定在绿意盎然、光彩夺目的福井！
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十年前，几乎毁灭世界的大灾难中，卫宫士郎被魔术师卫宫切嗣所救，成为其养子。
