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在《剧场版物怪：唐伞》的激烈对决后不久，卖药郎（神谷浩史配音）再次现身，这次他来到了大奥的内庭。先前事件过后，这里正经历一场动荡。出身名门的女子大友牡丹（户松遥配音）接替歌山成为新任总管，并开始推行一种严谨而平衡的领导方式。这种高压政策逐渐加剧了她与曾受天皇（入野自由配音）宠幸的资深花魁富贵（日笠阳子配音）之间的关系日益紧张，两人之间的裂痕日益加深。天皇的妻子有希子皇后（种崎敦美配音）所生的皇子即将选定监护人，一场突如其来的事件却彻底颠覆了富贵的命运。她产下了一个被视为“不祥之子”的婴儿，被年长重臣大友（堀内贤雄配音）视为威胁，从而成为一场权谋阴谋的目标。在男权体制编织的权力之网中，利益冲突与掩盖真相的手段迅速失控。与此同时，奇怪的事件接连发生，人们无故自燃，瞬间化为灰烬。卖药郎怀疑是物怪作祟，展开调查。然而，他所面对的，是一种神秘而不断变化的群体性威胁。这个物怪的真实身份，正是火鼠（日根住配音）之子。他们不仅攻击人类，还似乎在寻找自己的母亲，然而，这位“母亲”始终不肯现身。火鼠为何专门针对那些伤害新生儿之人？又是什么样的悲剧，让她悲痛至极、自焚不止？卖药郎深入大奥之中，揭开层层黑暗，追寻斩除物怪所需的三大要素：“形”、“真”与“理”，誓要揭示真相，平息灾祸。

本片是完全原创故事，超级英雄们不再是熟悉的样子，超人成为了佐德的儿子，蝙蝠侠成为吸血鬼，神奇女侠是“新神”，正义联盟为了摆脱被诽谤的罪名对科学家遇害事件展开调查。

广袤的澳洲荒原，飞禽鸟兽栖息于此，共同承受着大自然的馈赠与考验。在森林中住着一只名叫约翰尼的白色考拉，他与众不同的毛色惹来同伴的欺负，令他异常痛苦。偶然机缘，约翰尼被贪婪的袋熊经理人哈米什及其猴子助手黑金斯带入嘉年华，成为了畸形秀上的明星。在巡游的途中，约翰尼他们的马车翻到，他和哈米什、黑金斯意外来到了比拉峰。这里有清澈的水源，但是却被贪婪孔武的鳄鱼普格及其途中长期霸占，为此善良的小动物们和恶霸不断发生战争。

战斗机飞行员函南优一（加濑亮配音）来到基地报道，等待他的是全新的生活环境与熟悉的飞行战斗。在这里，函南优一遇到了各式各样的战友，与不苟言笑的长官草薙水素（菊地凛子配音）。函南优一获得了一架新战斗机，但是，基地里的战友们都对战斗机的前任驾驶员缄默不语。于是函南优一开始留意相关的消息，他渐渐知道，前任驾驶员已经去世，而事件本身与草薙水素有莫大的关系。随着调查的深入，函南优一逐渐发现惊人的真相，而他每天与敌人的战斗，似乎也隐藏着他不知道的意义。

全国大赛开幕在即，渴望一鸣惊人的樱木花道却因为底子太薄，连续三次被赶出球场，且一分未得。即使在晴朗明媚的日子里，樱木的心情也超级差，连续对他的死党和任何挡在面前找麻烦的人使出头槌。他希望私下里请木暮帮他集训，又不愿让大猩猩知道。当他和伙伴们路过某个球场时，刚好看到赤木晴 子在这里练习投球。就在此时，一台机车飞驰冲入球场，头戴安全帽的骑手腾空而起，绝杀灌篮。此人是津久武高中篮球部一年级新生南乡桄一郎，他不仅对樱木的头槌无动于衷，更具有令众人无法轻视的实力。接下来一场，湘北篮球队遇上了强劲对手津久武……
　　本片根据井上雄彦的同名漫画改编，为该动画的第二部剧场版。

林旺（宋晓宇 配音）是一头活泼可爱的小象，快乐的生活在云南中缅边境的丛林里。林旺的好朋友是一个名叫旺崽（李垚 配音）的中国男孩，一人一象之间友谊十分的深厚。平日里喜欢调皮捣蛋的林旺常常会惹出一堆的麻烦和笑料，但它依然深受动物们的喜爱。                                                                    好景不长，战争开始了，日本人的铁蹄踏破了丛林的宁静，林旺和旺崽双双被日本人捉去成为了苦力，在部队里，林旺认识了很多来自不同地方的和自己有着同样悲惨遭遇的大象们，他们决定联起手来进行反击。中国远征军的到来结束了林旺和旺崽的悲惨生活，林旺作为一头战象加入了军队之中。