袭击了二十世纪的地球的前所未有的大灾害·落星雨。在这场大灾害之下，世界多数的都市遭到毁灭。但，从陨石中发现的未知元素——万应素，让人类的科学技术加速发展，终於诞生出被称作“星脉世代”的、拥有特异之力的新人类。世界最大的综合战斗娱乐项目“星武祭”的舞台，由六所学院包围、通称为六芒星的水上学园都市“六花”。转学到星导馆学园高等部的特待生·天雾绫斗，为了实现自己的愿望，而发誓在这个都市中战斗。
身患绝症的林修去绝世岛求医，学了几年修仙法术后回归都市，却发现都市中卧虎藏龙，林修开始靠着自己精湛的医术，在都市中开始了修仙之旅。
《#碧蓝航线#》的衍生漫画 《#碧蓝航线 Queen's Orders#》宣布动画化~
林玄辞被困天渊百年，拒绝红裙姑娘结为道侣的提议，选择达成九个约定后出禁区，却修为尽废、灵根断裂。玄青宗因他魂灯重燃，由董问君带人寻回。回宗后，他道出师兄们的秘密自证未被夺舍，还得知昔日婚约对象柳舒瑶将与天玉宗联姻。东怡宫姚素素送礼解约遭拒，林玄辞见柳舒瑶后斩断因果。
