《晶码战士》是一部大型科幻动画片连续剧，以“环保”为主题，围绕“历险”、“励志”展开，讲述了四位主人公与他们的晶码兽为了保护地球，与外星球邪恶集团作斗争的故事。
天才剑修祝明朗为救同伴苍龙白岂变成废人，成为落魄少年，阴差阳错下，却与女武神黎云姿相遇。而后敌人驭龙而来，熊熊龙炎将荒城池吞没，只为杀落魄祝明朗泄愤。祝明朗死里逃生，化身为牧龙师，开启了自己的传奇之路。
林凡穿越修仙世界，身负巨债，连房租和修仙大学学费都交不起。前女友白雪找他借钱被拒，当场翻脸分手。绝境中林凡觉醒万倍返现系统，绑定女神消费就能获得高额返现。他迫使白雪当众买下玩偶，到手四百万返现，玩偶化身为战斗女仆灵儿。林凡还清债务、购得丹药功法，一举突破练气五层。入校后，白雪傍上练气四层的王骁上门寻仇，林凡强势打脸二人。
外星人记者伊克斯比、皮克斯比和克罗来到一个可爱但奇怪的星球——地球，在那里他们试图了解人类和他们的爱好。
被撤职的锦衣卫袁小棠与青梅竹马的方雨亭为寻找父亲失踪的线索潜入鬼街、在朋友石尧山等人的帮助下，一路逛鬼街、破机关、遇各路神秘人物……乱斗与阴谋轮番上演，随着旧事的重提，一切谜团都渐渐有了答案。
