故事发生在从近未来到两百年后的历史跨度上，地球文明被三体用一种叫做智子的超级科技锁死，基础研究因而停滞不前。但人类仍然需要在此基础上不断前进来抵御即将到来的三体人的进攻，守卫自己的家园和人类文明。在更广大的基础上，三体文明和人类文明都是黑暗森林下的猎手，小心翼翼的保护好自己并且清理别人，为文明的存续而挣扎。
在该系列中，猫和老鼠在现代化的环境中相遇，讲述了全新的故事和全新的人物，更是进入了从中世纪城堡到一个疯狂科学家的实验室奇妙的世界。
在偏僻的小村庄——雏见泽村过着愉快生活的少年前原圭一，得知了在这和平村庄中发生的分尸杀人案件。而此事件，又与被称为「御社神的作祟」的一连串离奇死亡案件有所关联。
秋之回忆 3.5 ～超越回忆～ Vol.1（2004 年 5 月 12 日发售） 秋之回忆 3.5 ～超越回忆～ Vol.2（2004 年 6 月 23 日发售）
