故事发生在名为恩典农场的孤儿院内，在这里生活着很多失去了亲人，无家可归的孩子们，他们共有36人，每天，在劳作和玩耍之余，孩子们还要进行学习和测验，其中，佼佼者是名为艾玛（诸星堇 配音）的女孩和名为诺曼（内田真礼 配音）的男孩。负责管理和看护这些孩子们的女性名叫伊莎贝拉（甲斐田裕子 配音），孩子们喜欢喊她“妈妈”。每过一段时间，都会有一个孩子被收养离开农场，生活在这里的孩子们都将此作为自己的人生目标。
30年前，未知的“侵略性外来生物”突然出现，世界曾一度濒临毁灭。人类与这些被称为“侵略种”的生物相互争夺生存空间。虽然目前人类的安全勉强得到了保障，但世界随时可能走向终结。人们在恐惧死亡与毁灭的同时，只能对危险和灾难视而不见，麻木地过着日常生活。在这样的世界里，联合国危险生物调查机构“EXCEEDS”为了抵御“侵略种”带来的危机与灾害，开始了行动。故事的开端位于远东的岛国“瑞穗”。一位在离岛上生活、以驱除“侵略种”为业的猎人少女——久濑椎名。她唯一的愿望就是与家中唯一的亲人妹妹刹那平静地生活下去。然而，降临在椎名身上的事件究竟是——？
初中时经历过100次心碎的爱城小太郎，终于在高中找到了女朋友！当她在神社祈祷时，爱之神出现并告诉她，她注定会在高中遇到 100 个人。然而，根据上帝的说法，如果一个人遇到了自己的灵魂伴侣，却没有爱上那个人并找到幸福，他们就会死去……与灵魂伴侣的一次次邂逅正在等待着他——小太郎将会怎么做呢？这100个女朋友的命运将会如何？ ？
围绕桃夭、柳公子、磨牙一行在京师的游历，展示了人与人，人与妖之间的距离或许并没有想象中的那么难以逾越。无论是桃夭与丁三四的互动，还是老张带给柳公子跨越人生和厨艺的指点，亦或是磨牙面对傒囊时的左右为难，都让一行人各自获得新的成长。而同时，封无乐，陈白水等人也获得各自的救赎，或许人生旅途就是这般互相影响，五味杂陈。
冒险者们向未知发起挑战，诸神因兴奋而热血沸腾， 全世界最为热烈的城市——迷宫都市欧拉丽。位于城市中心，给都市带来无限财富与荣华，潜藏众多混沌的大洞穴——“地下城”。一只怪物在这深渊中诞生。“这里……是哪里……？”围绕着能够与人交流沟通的龙之少女，都市逐渐被卷入前所未有的异常事态中。人与怪物。漫然存在的价值观、常识遭到破坏，冒险者贝尔·克朗尼与女神赫斯缇雅，迎来决断之时。
