人见人怕的六届最强女魔头一夜之间惨遭变小，被欺负？被压迫？被暗杀？不可能的！喂，那边那个废柴剑修，送本尊回家的任务就交给你了！
万物皆有灵，自然之力汇聚成了各种拥有意识的仙子。但是，由于人类不爱惜自然更有被封禁的力量觉醒，仙子们受到了伤害。人类少女遇到了来自水底的仙子，并与他相知多年。但是两人却无法跨越仙、人之隔。少女在奇妙的旅途中，决心寻找属于自己的力量。她相信人类也是自然的一环，定有人与自然和谐共存之法。她能否守护自然？
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SIDE6沉浸在一片安宜祥和的气氛中，这里远离战场，几乎从未发生过什么战事，驻守在这儿的联邦军的部队也并不多，这一点，并不使少年阿鲁高兴，因为他是一个军事迷，渴望看一下激烈的战斗场面。一日阿鲁正与朋友们交流时，殖民地内发生了骚动，这是由吉恩的小股侦察部队与联邦发生的冲突所引致，不久，一架受了伤的扎克（改），掠过阿鲁的上空，坠落在离他不远的林间草坪上。被击落的吉恩新兵巴尼，用自己的军衔章换取了阿鲁的摄影机磁卡，这里面记录有阿鲁从联邦的工厂里到的MS组装画面。此外，还有几日前从地球搬来的阿鲁家的邻居红发女郎克丽丝的倩影。巴尼获取的情报，引起了吉恩军的注意，他们立即组建了一支突击小队，执行破坏高达的任务。于是，巴尼所在的小队，依靠一场小规模的战斗的混乱，再度潜入SIDE6。在宇宙殖民地中，巴尼又一次与阿鲁相遇。
