故事延续第二季主线，灵界与斗魂卫在利益纠葛之下冲突不断，本季灵界派出强盛军队欲对斗魂卫赶尽杀绝，两方势力都在以正在举办门宗大会的五法山为中心汇集，在这里发生着惨烈的战斗与冲突。
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《JoJo 奇妙冒险：石之海》第 13-24 集将于 9 月 1 日全球首播，Netflix 独家！空条徐伦遭人诬陷犯罪，在又名“水族馆”的最高戒备矫正机关绿海豚街监狱蹲苦牢。徐伦的父亲空条承太郎为了救女儿出狱，前来探监……然而这一切却正中神秘替身与首脑白蛇的下怀。白蛇想夺取承太郎的记忆：“通向天国的阶梯”，而承太郎多年前的手下败将迪奥同样虎视眈眈。白蛇出手攻击承太郎，夺走他的替身能力和记忆光碟，害得他陷入假死状态。徐伦为此决定留在狱中，伺机夺回父亲的光碟。在新伙伴艾梅斯·罗斯提罗、幽浮一族、安波里欧·阿尔尼优、天气预报和纳鲁西索·安纳苏的陪同下，徐伦力战潜入监狱的替身使者，矢言揪出白蛇背后的势力，并夺回父亲的替身能力和记忆。乔斯达家族与迪奥的纠葛命运横跨世纪，这回上演最终战斗，更加刺激的全新篇章即将登场！
日本各地出现了异空间「魔都」──由于只有女性能从魔都的「桃」得到特异的能力，因此便由女兵组成了「魔防队」。某一天，过着抑郁生活的男高中生──和仓优希不小心闯进了突发性产生的魔都入口，在那里，遇到了「魔防队」第七组的美丽队长──羽前京香，而她竟向优希宣言：「我要你当我的奴隶。」
解开封印的绝世王者古玄尘，终于踏上了修行之途，在不断修炼变强的途中，他也了解到自己真正的身世，面对残酷的真相，古玄尘并不怨天尤人，他只愿以手中剑破除世间一切不公不义！他来到更广阔的世界，面对更强的敌人，演绎更辉煌的热血传奇！
叶楚云意外穿越到了玄幻世界“潜龙大陆”，成为流云宗的一名杂役。三年后，即将十六岁但修为只有最低境界的叶楚云面临..
