结束了与新短笛大魔王的天下第一比武大会，我们的地球迎来了长达五年的和平时期，数次拯救世界的孙悟空（野泽雅子 饰）在此期间与琪琪走入婚姻殿堂，并生下了可爱的儿子悟饭。然而更大的危机一波又一波向勇敢的战士们袭来。打头阵的赛亚人拉迪兹，意外揭开了悟空的身世。宿命的对手贝吉塔则 让悟空真正见识到高手的存在。在此之后，那美克星、弗利札、超级赛亚人、人造人、未来少年、魔人布欧。精彩戏码接连上演，拉开了龙珠Z的宏大篇章……
当发现皇帝最宠爱的妃子玉波公主怀孕时，猫猫重返玉宫，继续担任试毒师。他们整天警惕着，试图阻止针对皇后和皇帝孩子的事件再次发生。新贵妃柔然入宫，她的父亲是前任皇帝时代的一位高级藩王；一桩史无前例的悬案威胁着仁慈的生活；而嫌疑人翠玲却失踪了。就在气氛紧张之际，一支来自异国的商队，甚至还有提出无理要求的特使到来。宫殿之中，云雾开始变得更加阴暗。一个新的棘手案件等待着猫猫和仁史。这些事件最终都会发展成为涉及整个国家的大事件。
2772年，一颗来历不明的流星撞击地球，彻底改变了地球和部分居民的生活。经典动画《乐一通》人物的后代也参与其中，他们成为了拥有超能力的英雄，却依然保留着祖先古怪的性格。
真新镇的少年年满10岁之后，就可以得到训练神奇宝贝的资格。10岁的少年小智（松本梨香 配音）以成为最厉害的神奇宝贝训练大师为目标，即将踏上了修行之旅。小智因为早上赖床迟到，险些失去挑选神奇宝贝的资格，无奈下他领走了一只被挑剩下的神奇宝贝——皮卡丘（大谷育江 配音）。皮卡丘又名电气鼠，虽然长相可爱，但性格含羞内向却又不亲近人类，稍有不满就乱放电电人，暴躁的脾气让小智吃尽了苦头。大木博士把神奇宝贝图和宝贝球作为践行礼物送给了小智。在小智和皮卡丘的前方，神奇宝贝的世界有许多谜题和探险在等着他们，迎接他们的到底是光明还是黑暗，小智能否如愿成为神奇宝贝大师呢？
何方知与阿牙循着线索一路探寻，终于找到了借刀杀人除掉林大人的幕后之人。此后，上凤鸣山，受凤阁主所托，前去西北救一人……在这一路上，何方知又遇到了形形色色的人，他们或居庙堂之上，或处江湖之中，每个人都有自己的选择，都在用自己的方式，坚持自己相信的东西……
