人类殖民星球遭到外星人库克托尼亚人的袭击，守护驻军被消灭，留下 13 名儿童。故事讲述他们乘坐地球军事训练舰“Janus”号，与使用名为“Roundburnians”的人形武器的外星人作战，以拯救被外星人俘虏的家人和朋友。故事根据儒勒·凡尔纳的小说《两年假期》（男生称之为“两年假期”）改编。宇宙版《少年的假期》的构思是在《机动战士高达》的企划过程中产生的，但随着《高达》走向了不同的方向，本作是以此为主题的新动画，因此富野由悠季的名字被冠以“原作作者”之名。
刺客景阳在行刺女皇时行踪泄露，离奇穿越至几百年后的现代社会，偶遇了与女皇长相完全相同的社畜女孩陆思甜。原本过着一地鸡毛生活的陆思甜平白遭受灾祸，景阳也随之开启了鸡飞狗跳的追杀与同居爆笑日常
因历代祖先的形象，以及父亲的滥情行径，而长年坚持独身主义的大学生赤神明光，因一场意外邂逅少女苍叶结月，并对她一见钟情。 茶饭不思的明光为祛除杂念，决定休学出家，不料前往的寺庙正是结月居住的尼姑庵。
洛小熠、欧阳零、路子涛、玫等人怀抱着各自的愿望来到了俢爵岛，参加了龙骑战轮大赛。
